만성피로증후군의 정확한 원인에 대해서는 아직 밝혀져 있지 않습니다. 어떤 연구자들은 이 질환이 특정 바이러스로부터 기인하는 것으로 추정하기도 하지만, 분명하게 규명된 적은 없습니다.
  최근의 연구는 만성피로증후군이 신경계통의 (자가)면역반응으로 인한 염증 때문에 유발될 수 있음을 시사해주고 있습니다. 즉, 바이러스성 질환을 앓음으로 신체 내부에서 면역반응이 발생하면 만성피로증후군이 초래될 수 있다는 것입니다.

  다른 위험요인으로는 연령, 예전의 병력, 스트레스, 환경요인, 혹은 유전적 소인 등도 만성피로증후군에 관여할 수 있습니다. 만성피로증후군은 30~50세 사이의 여성들에게 잘 오는 것으로 알려져 있습니다.
  만성피로증후군의 증상은 가장 흔한 바이러스성 질환들의 증상들(근육통, 두통, 피로감 등)과 유사하며, 흔히 수 시간에서 수 일 사이에 발생하고 6개월 이상 지속될 때가 많습니다.